Основным видом деятельности медицинского центра не является оказание бытовых услуг, соответственно, к категории субъектов предпринимательства, имеющих право на льготу в виде освобождения от уплаты торгового сбора, Вы не подпадаете. То есть Вы несете обязанность по уплате торгового сбора.
В описанной Вами ситуации Вам стоит по закону воспользоваться своим правом на вычет суммы, уплаченной в качестве торгового сбора, из суммы налога на прибыль или из суммы единого налога, если Вы используете упрощенную систему налогообложения.
Со ставками налога на прибыль Вы можете ознакомиться здесь >>.